港澳通行证1年一次签注和3个月一次签注的不同只在于有效期。1年一次的有效期是一年，3个月一次的有效期是3个月。1年一次，指的是本次签注有效期为一年。一年过去，这次签注还没有使用，那么想要使用就必须重新续签才行。并不是一年只能去一次的意思。1年一次，当在一年之内这一次有效签注已经使用，那么这一次的签注就已经不再能使用，须得重新续签才可以再次使用。也就是说一年其实是可以去很多次的。深户办理港澳通行证的流程如下：1、上网申请。申请人登陆出入境网上申请系统，根据提示填报个人基本信息及申请办理类别；预约前往出入境办理厅递交材料的时间。2、前台面见、验核材料。申请人按照网上申请时的预约时间和地点，前往机关出入境管理部门递交、验核申请材料并缴费。