公司已注销税务局是否还会查账要看具体情况定。根据《税收征管法》第29条规定，账簿、记账凭证、报表、完税凭证、、出口凭证、以及其他涉税资料应保存10年。虽然你的公司注销了，但是以前合作过的客户还在经营，并且有些款项没有结清或没开，因此税务局到客户公司进行稽查时，可能需要查看已注销公司的账簿。一、税务登记怎么注销。