法律分析：1、可以。员工自动离职是指员工没有按照法律规定提前通知单位自行离开单位，那么单位是可以以此辞退员工，并且扣除员工部分奖励性待遇作为处罚，但是员工工资还是需要支付，需要员工在单位办理离职手续之后单位支付员工工资。2、如果单位拒绝支付是可以申请劳动仲裁进行维权的。或者先向劳动监察大队投诉。《工资支付暂行条例》。第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。第十各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。(一)克扣或者无故拖欠劳动者工资的。(二)拒不支付劳动者延长工作时间工资的。(三)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。