已经超过诉讼时效的民事案件，不会直接判决原告败诉，只有在被告提出诉讼时效抗辩的时候，才会判决原告败诉。如果被告没有提出诉讼时效抗辩，原告有足够的证据证明，不能主动适用诉讼时效，应该判决支持原告胜诉请求。一、公司债权债务什么时候会失效。公司债权债务不会失效，只是会在超过诉讼时效的情况下丧失胜诉权，丧失胜诉权并不意味着债权债务失效。只是如果通过诉讼的方式追讨债务时，如果对方提出诉讼时效抗辩，原告一方会丧失胜诉权，会被驳回诉讼。债权债务的诉讼时效为三年，从债务履行期限届满之日起计算；如果没有约定履行期限的，则债权人随时可以要求债务人履行，诉讼时效从债权人提出履行要求之日起计算。二、超过诉讼时效的房屋合同怎么处理。