男性特有的遗传学特性使得伴X染色体隐性基因的发病率与其在男性中的基因频率保持一致。男性只携带一条X染色体，因此，当一个基因（以Aa表示）为隐性时，男性个体中的基因频率Xa就等于这种基因型XaY的数量，即Xa/（XAY+XaY）。发病率的计算同样基于这种基因型频率，即XaY的出现概率。由于男性只有一种X染色体，所以发病率直接反映了基因的频率，即伴X染色体隐性基因在男性中的发病率等于该基因的基因频率。