男性特有的遗传学特性使得伴X染色体隐性基因的发病率与其在男性中的基因频率保持一致。男性只携带一条X染色体，因此，当一个基因（以Aa表示）为隐性时，男性个体中的基因频率Xa就等于这种基因型XaY的数量，即Xa/（XAY+XaY）。发病率的计算同样基于这种基因型频率，即XaY的出现概率。由于男性只有一种X染色体，所以发病率直接反映了基因的频率，即伴X染色体隐性基因在男性中的发病率等于该基因的基因频率。
伴X染色体隐性遗传的特点在于它的遗传模式。这种遗传方式表现出隔代交叉遗传，即致病基因可能从母亲遗传给儿子，而不是女儿。由于男性只有一个X染色体，所以男性患者通常多于女性，即“女病，父子病”。具体实例包括常见的红绿色盲症、血友病，以及在果蝇中表现的白眼遗传等遗传疾病，如进行性肌营养不良、家族性遗传性视神经萎缩、眼白化病等，以及先天性夜盲症和血管瘤病等。
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