缺乏良好的排便习惯也是婴儿便秘的一个重要原因。儿童自幼应养成定时排便的习惯，通过条件反射的作用定时排便。孩子因为贪玩而忽视便意，时间久了，肠末梢神经对粪便刺激的敏感度下降，粪便在直肠中停留时间过长，水分被大量吸收，变得干燥和硬结，从而难以排出。精神因素同样可以引起婴儿暂时性的便秘，如孩子受到突然的精神刺激或生活环境的改变。某些疾病也可引起便秘，如肛门狭窄或先天性肌无力等。新生儿便秘的原因主要有：人工喂养导致的皂钙较多，易引起大便干结；乳量不足导致的大便减少或暂时无大便；消化道肌层发育不全引起的便秘，有时伴有吐奶现象。外科性疾病也可能导致新生儿便秘，如肠道闭锁、肠狭窄等，常伴有呕吐和腹胀现象。