此外，自1993年起，中国对东盟已连续11年保持贸易逆差，若长期维持这一状况，将对中国和东盟的贸易平衡及中国经济带来不利影响。关税与非关税保护措施的降低，将进一步扩大中国从东盟的进口，加剧贸易逆差，给中国带来压力。自由贸易还对中国的服务业造成冲击。由于我国在金融、通讯和专业服务等领域不具备比较优势，东盟部分国家如新加坡在这些领域具有较强的竞争力。中国和东盟启动自贸区后，将对这些行业放开，东盟企业将进入中国市场，与国内相关行业产生竞争，对国内服务业造成冲击。