截至2018年9月，苏州大学共设有134个本科专业；50个一级学科硕士学位授权点，25个专业学位硕士点；28个一级学科博士学位授权点，1个一级学科专业学位博士点，29个博士后科研流动站；4个国家重点学科，1个省级重点学科，8个江苏高校优势学科，12个省级一级学科重点学科，5个江苏省重点序列学科，15个“十三五”江苏省一级学科重点学科。截至2019年3月，学校化学、物理学、材料科学、临床医学、工程学、药学与毒理学、生物与生物化学、神经科学与行为科学、分子生物与遗传学、数学、免疫学共11个学科进入ESI前1%，化学、材料科学2个学科进入ESI前1‰。