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主礁曾母礁由礁核和礁翼两部分组成。根据中国科学院南海海洋研究所实验3号船1985~1986年调查最浅处水深为17.5米，形如纺锤，礁丘脊部呈北西走向，面积2.12km?。
曾母暗沙是中国固有领土，战略地位极为重要，中国在此投放有主权碑。因为是水下暗沙，无法驻军，中舰和海警执法船不定期巡航。