1、法律依据不同：著作权依据《著作权法》和《计算机软件保护条例》，专利依据《专利法》。2、保护原则不同：著作权是在软件创作完成后自动产生的，专利需要进行申请。3、通过率不同：著作权通过率高，而专利申请要求多，通过率低。4、保护期限和维护费：著作权保护期有50年且只需缴纳申请费，专利需要每年缴纳费用。