夫妻起诉离婚时，两个子女抚养权的分配是。1、双方就子女抚养权归属协商一致的，按照双方当事人的意思分配。2、双方就子女抚养权归属协商不能达成一致的，一般按照一人抚养一个子女的原则进行判决，判决抚养权时应当参考子女的年龄性别、父母的经济状况等因素。第一，两周岁以内的子女由母方抚养，但下列情形可随父方生活。（一）母方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病子女不宜与其共同生活的。（二）母方有抚养条件不尽抚养义务而父方要求子女随其生活的。（三）因其他原因子女确无法随母方生活的。第二，两周岁到八周岁的子女按照有利子女成长的原则判决，有下列情形可予优先考虑。（一）该方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的。（二）该方无其他子女而对方有其他子女的。