运输毒品罪和非法持有毒品罪的主要区别在于非法持有毒品罪是运输毒品罪的补充罪名，仅适用于非以运输毒品为目的或延续的情况，否则应以运输毒品罪定罪。法律分析；运输毒品罪和非法持有毒品罪的主要区别在于。非法持有毒品罪是运输毒品罪的补充罪名，只有行为人不以进行运输毒品犯罪为目的或者作为运输毒品犯罪的延续而存在的，才能以非法持有毒品罪论处，否则应以运输毒品罪定罪处罚。拓展延伸；毒品犯罪中非法持有与运输的法律规定与司法实践。