1、双方如果仅仅是同居关系，协议也仅仅是对于双方同居关系的规定，双方均没有配偶的同居关系并不是法律所调整和保护的关系，公证此类协议并没有相应的法律意义，并不属于公证的范围。2、如果是对于同居期间的财产进行分割签订的协议，属于共有财产的分割问题，是允许公证的。3、如果协议约定涉及到同居期间生育的子女的抚养问题，应当参照最高法关于离婚案件中子女抚养问题的相关规定，对于子女抚养问题作出妥善处理，是允许公证的。一、民法典同居关系财产如何分割。同居期间的财产分割按一般共同财产处理。当事人之间如果是协商解除同居关系的话，同时也可以自行对财产进行分割，要是协商不了则可以向起诉。如果直接请求解除同居关系的话，是不会受理的，但可以对同居期间的财产、子女抚养以及债务等问题作出判决。