1、海南医学院要比皖南医学院综合实力更强，海南医学院在全国的排名是第342名，皖南医学院在全国的排名是第351名。2、海南医学院要比皖南医学院环境更好，海南医学院位于海南省省会海口市，皖南医学院位于安徽省芜湖市，两地相比较海口市交通便利。