处理合同纠纷的方式是：当事人可以自行协商处理；可以请其他组织调解处理；可以向提起民事诉讼，由调解或者作出判决；也可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。法律依据：《民事诉讼法》第一百二十三条起诉应当向人民递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民记入笔录，并告知对方当事人。第一百二十九条人民对决定受理的案件，应当在受理案件通知书和应诉通知书中向当事人告知有关的诉讼权利义务，或者口头告知。《仲裁法》第四条当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。小额合同纠纷如何处置。