在合同上加盖分公司印章一般认定为合同有效。根据《公司法》第14条第1款规定：公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。二、对于分公司印章的管理。企业为了业务发展需要，会在不同的区域设立分公司。虽然分公司办理营业执照，但却不具有法人资格，不能承担民事责任，所以分公司加盖印章所产生的法律责任是由设立分公司的总公司负责。为了防范风险，应当加强对分公司印章的管理。1.制定分公司印章管理的规章制度。必要时，可以由分公司的负责人对加盖分公司印章产生的法律后果承担担保责任。