劳动纠纷案件的主要问题是举证责任倒置。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。如果争议事项的证据由用人单位掌握，那么举证责任应由用人单位承担。因此，在劳动争议中，原告举证和举证责任倒置的原则适用。法律分析；一、劳动纠纷案件是否举证倒置。劳动仲裁一般由劳动者承担举证的责任，但相关证据由用人单掌握的，举证责任倒置，由用人单位举证。《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供。用人单位不提供的，应当承担不利后果。第二十申请人申请仲裁应当提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。仲裁申请书应当载明下列事项。