1、认证途径不同，自营旗舰店是指生产厂家自己经营的旗舰店；官方旗舰店指的是经生产厂家官方认可旗舰店。2、销售方式不同，自营店就是销售平台的供货商；而官方旗舰店就是品牌方开的店铺，象征着品牌。