1、级别不同：上级部门是指在组织结构中处于更高层次的部门，而关联部门则是指在同一层次或不同层次但有关联的部门。2、职能不同：上级部门通常拥有更高层次的决策权和管理权，其职能范围更广，往往是下属部门的主管部门；而关联部门则是根据工作需要和职能设置而来，职责范围相对。