1、医院使用银联的“一账通”支付服务，那么支付的款项来自消费者的银行卡账户。消费者在使用“一账通”支付时，需要先绑定银行卡，然后在医院扣款时，银行会从消费者的银行卡账户上扣除相应的款项。2、由医院自己的账户支付，这种情况下，就需要确定具体情况。无论哪种情况，支付的款项都是从钱的实际拥有者的账户中扣除，以完成交易的支付流程。