若是鼠鱼还没有成年的话，那么比较难区分公母。在成年之后，可以通过以下几个方面区分。首先是体型，母鱼的体型是比较大而且胖的，公鱼的体型则是纤细的。其次是外观，公鱼的腹鳍比较尖锐，母鱼的则是比较圆；在繁殖期，可以看它们的腹部，腹部膨胀的是母鱼。对于一些特殊的品种，还可以通过它们的颜色来区分。