分辨珍珠龟公母主要是看外表。先从外部轮廓看，雄龟是比较窄而长的，而雌龟是又宽又圆的。其次看它们的腹甲部分，雌龟更加平坦一些。再次看它们的尾巴，雌龟的尾巴更细长，雌龟尾巴是粗短的。最后看泄殖孔，雄龟的泄殖孔离腹甲边缘要远一点，形状是长形的，而雌龟的近似于圆形。