不同性别的锦鲤外观差别比较大。首先是体型，母鱼的体型比公鱼丰满；然后是头部，母鱼的头部窄、长，公鱼的头部上面有突起；腹部也有差别，母鱼的腹部比公鱼丰满一些；母鱼的胸鳍是椭圆形的而公鱼的则比较尖；生殖孔突出是母鱼，生殖孔向内凹则是公鱼。在繁殖的季节，还可以看它们有无白色追星。有追星的是公鱼。