猫的肛门腺位于肛门附近，位于肛门括约肌里面的囊袋状腺体，共有两个腺体。以肛门为一个圆形来说，大约在肛门五点钟和七点钟方向的位置各有一个腺体。会分泌带臭味的分泌物，可能具有气味记号，起到个体间的识别或保护作用。由于肛门腺功能比较特殊，同时这个部位很容易遭受细菌感染，特别是当肛门腺出现堵塞情况时，很容易继发肛门腺炎，同时还会出现比较难闻的恶臭，严重时会出现肛门腺穿孔。