狗耳朵很干净但总甩头的原因：1、很可能是它的耳朵上长癣导致的，而且它会经常用腿去挠它的耳朵，最好给它做好清洁之后，喷上药水等待恢复。2、狗狗被自己挠伤之后，在愈合的时候就会显得非常痒，继而导致它出现不停甩头的现象。3、狗狗的耳朵进入异物，或者因为皮肤太干燥，也会导致它出现甩头的行为。4、可能是因为狗狗的头部有跳蚤、虱子、螨虫等寄生虫导致。5、也可能是狗狗的耳道内进水、感染真菌等因素引起的。