如何处理肛门囊肿：1. 先去医院了解囊肿情况，根据情况选择药物治疗、手术治疗、生活护理等方式进行处理。2. 药物治疗：可在发病初期使用高锰酸钾外用片进行温水坐浴，并联合使用头孢克洛胶囊等药物，能起到预防感染的作用；也可以外用如意金黄散、活血止痛散等缓解症状。3. 手术治疗：若症状严重需要切开引流脓液，并做好消毒、换药处理。若囊肿异常增大、剧烈疼痛等，需要经手术切除病变部位，并进行病理学检查。