法律分析。司法拍卖的车辆有抵押的，可以对车辆进行拍卖，但拍卖所是的款项优先偿还质权人的债权，然后再偿还其他债权。法律依据。《中华人民共和国民法典》。第三百九十四条 为担保债务的履行，债务人或者第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，债权人有权就该财产优先受偿。前款规定的债务人或者第三人为抵押人，债权人为抵押权人，提供担保的财产为抵押财产。