洪都拉斯木纹龟虽然智力不及人类，但拥有大脑两半球和外侧大脑皮层，具有一定分析能力，经过训练可辨别方向、记住吃饭时间。它们行动与学习能力相对较缓慢，但能认识主人并产生本能反应。通过多点耐心照顾、互动、喂食、抚摸等日常护理，洪都拉斯木纹龟认识主人会逐渐对其产生信任感。