三线仓鼠体背自吻至体后端为灰棕色，背毛基为深灰色，端部为棕色，毛尖部为棕黑色。身体的腹面从颏、喉至胸腹部均为灰白色。毛基为深灰色，毛尖为污白色。三线仓鼠体侧背腹毛之间有明显的界线，形成3个大的波纹。腹侧的灰白色毛向背侧方突入，形成基部连续的3块灰白色斑，在尾基两侧也各具一小型灰白斑。各斑块的上缘与背毛交界处形成波状棕黄色界线。尾背面灰棕色，端部污白色与腹面相同。