个人所得税退付手续费的申报方法如下：1、通过个人所得税APP申请；首先下载并注册账号，登录后查询本年度的纳税明细，在办税界面选择综合所得汇算申报进行申报。2、前往自然人电子税务局申请；适合收入、扣除等事项较多、情况较复杂的纳税人。3、前往办税服务厅申请；需要填写纳税申报表，并携带本人有效身份证件。个人所得税退付的注意事项。1、核实退付原因：确保个人所得税退付是由于多缴税款或者税法规定的退税情况导致的。2、准备相关材料：包括身份证明、税款缴纳凭证、退税申请表等。3、了解申报流程：通常需要向税务机关提交退税申请，并按照要求填写相关表格。4、确认退付金额：核对退付金额是否与实际多缴的税款相符。5、注意申报期限：退税申报通常有一定的时效性，需在规定时间内完成。