瓜子可以生食或炒熟后吃，一般认为瓜子生吃更好一些，主要是考虑其营养成分保留得更好。生瓜子含有丰富的脂肪、蛋白质，以及人体所需的多种维生素和矿物质等，营养丰富，生吃可以最大限度地保留瓜子的营养物质。而炒瓜子会在炒制过程中放置各种调味剂，炒熟后的瓜子风味种类繁多，虽然味道较佳，但其中的部分维生素，如维生素C、B族维生素等不耐高温，高温炒制过程中会一定程度上破坏这些维生素，如果长时间高温炒制，甚至会损失绝大部分营养物质。