法律分析：根据《中华人民共和国民事诉讼法》规定，职务犯罪被告人申请赔偿的时效为两年。该规定适用于职务犯罪被告人向受害人或其近亲属请求赔偿的情形。法律依据。1.《中华人民共和国民事诉讼法》第一百五十四条规定：“向人民提起诉讼请求人的请求权利，应当自知道或者应当知道权利受到侵害之日起一年内行使；逾期不行使的，不予受理。但是，法律另有规定的除外。”。2.《中华人民共和国刑法》第八十规定：“国家工作人员在依法执行职务过程中，滥用职权、玩忽职守，造成重大损失国家利益或者群众利益，构成犯罪的，依法追究刑事责任；对受害人造成损害的，应当依法承担民事赔偿责任。”。