支付宝好医保住院医疗和长期医疗在保费、承保的保险公司、最高保额和免赔额不同。其中支付宝好医保住院医疗的最高保额为600万，免赔额为每年1万。长期医疗的最高保额为400万，免赔额为每6年累计1万。