合同专用章是否有编号不影响合同效力，只要合同章是单位的合法印章，当事人有民事行为能力且合同内容符合法律规定，合同有效。公司合同专用章与公章在管理、用途和效力上存在差异，专用章用于合同签订，仅限于合同效力，而公章代表公司，涉及一切事务。专用章的刻制是为了实现合同的专项管理，控制合同风险。法律分析；合同专用章没有编号。合同专用章是否有编号是不影响合同的效力的。只要该合同章是单位的合法印章，且合同双方当事人有相当的民事行为能力、意思表示真实、合同的内容符合法律规定，所签的合同就有效。合同章与公章有哪些不同。从法律上说，公司公章与公司合同专用章在合同签署的效力方面没有差异，公司之所以在公章之外，还另行刻制合同专用章，主要原因如下：1、因为公司公章与公司合同专用章在使用与管理上存在不同。