医疗事故鉴定程序包括向卫生行政部门提出申请、卫生行政部门受理申请、医学会组织鉴定、随机抽取专家组成鉴定组进行鉴定。根据《医疗事故处理条例》规定，医疗机构报告重大医疗过失或当事人申请处理医疗事故争议时，需要进行医疗事故技术鉴定的，应由医学会组织鉴定；医患双方协商解决争议且需要鉴定时，由双方共同委托医学会组织鉴定。法律分析；医疗事故鉴定程序如下：1、当事人向卫生行政部门提出医疗事故鉴定申请。2、卫生行政部门受理申请。3、安排医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。4、专家库中随机抽取专家组成鉴定组，进行鉴定。《医疗事故处理条例》第二十条规定，卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后。