证明夫妻分居的证据主要有以下几种：一方在外居住的房屋租赁合同；双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；一方向另一方发出的书面分居文书；双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实。法律依据；《民事诉讼法》第六十三条，证据包括： （一）当事人的陈述；（二）书证；（三）物证；（四）视听资料；（五）电子数据；（六）证人证言。（七）鉴定意见；（八）勘验笔录。证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据。