1、超过申请执行期限后重新出具借条是合法的，但是前提必须是属于双方当事人对于重新出具的借条都是认可的。重新出具借条的时间认定规定是会导致诉讼时效的中断，规定的诉讼时效中断的情形包括：当事人一方直接向对方当事人送交主张权利文书，对方当事人在文书上签字、盖章或者虽未签字、盖章但能够以其他方式证明该文书到达对方当事人的；对方当事人为法人或者其他组织的，签收人可以是其法定代表人、主要负责人、负责收发信件的部门或者被授权主体；对方当事人为自然人的，签收人可以是自然人本人、同住的具有完全行为能力的亲属或者被授权主体。