首先在使用人群上，新农合是新农村合作医疗是农村户口的民众购买缴纳，医保是居民医疗保险是非农业户口的民众购买缴纳。其次在报销比例上有所差异，医保起付线比新农合高，在大医院的报销比例稍高一些，交钱也多一些。新农合在则乡镇医院报销比例高。