华佗是被曹操杀死的。关于华佗之死，在《三国演义》中被描绘成曹操患上了头风病，华佗在诊断后，建议将曹老板的头颅劈开，做一个外科手术，方可治愈。曹操一听，这简直就是在谋杀自己，于是以刺杀的罪行将华佗关押拷打致死。