不一样。主要区别在投保对象不同。新生儿医保是城镇居民医保，主要针对城镇户籍的居民，并且只能在户籍当地参保，由门管理。农村合作医疗的参保对象是农村户籍居民，新农合医保是由卫生部门管理。