新生儿办理农村合作医疗需要凭出生证、户口簿到县农医中心增加姓名等资料。可享受新农合补偿的同等待遇。新生儿农村合作医疗的办理流程。1、为新生儿办理入户手续。只有在新生儿取得本市户籍以后，才有资格参加婴儿医疗保险。2、到当地的医保服务点为新生儿办理参保手续，同时缴纳相应的费用。在办理参保手续时，家长应向工作人员提供户口本、出生证等资料的原件和复印件。3、领取门诊医疗的就医凭证。这个凭证包括《社会保障卡》和《就医记录册》。4、领取住院医疗的就医凭证。这个凭证是指《少儿住院基金医疗证》。