离婚协议变更程序：领取离婚证后，以正当理由要求变更子女抚养关系或抚养费，向婚姻登记机关申请变更，填写自愿离婚变更协议，经审查属实后，机关准予变更并加盖专用章。法律分析；离婚协议变更程序如下：1、双方领取离婚证后，以正当理由要求变更子女抚养关系或者增减子女抚养费的，可以向原受理离婚登记的婚姻登记管理机关申请变更协议，填写自愿离婚变更协议。2、婚姻登记管理机关经审查属实的，应当准予变更，并在自愿离婚变更协议书上加盖婚姻登记管理机关专用章。拓展延伸；离婚协议修改的注意事项有哪些。