索隆的眼睛是被他的鹰眼所伤。在《海贼王》的故事中，索隆在与鹰眼的战斗中失去了左眼。这场战斗极有可能是双方全力以赴的对决，由于剑士之间的对决往往非常激烈，因此在这种状态下，即使是最轻微的伤害也可能发生。尽管有说法提到索隆为了追求更高的力量自我阉割了左眼，但这种说法并不符合原作的内容。综合考虑，最合理的解释是索隆在与鹰眼的战斗中受到了伤害，导致左眼失明。