青之驱魔师以住在修道院中的少年奥村燐作为主角，继承了恶魔之血的他，与资优生的双胞胎弟弟雪男完全不同，雪男以十三岁的最年少记录就获得了驱魔师的称号，而奥村燐却完全不知道自己未来想要做什么，就在某日，奥村燐的面前出现了一位自称为其父亲的魔神，并计划将他带到恶魔居住的虚无界，而修道院的神父，同时也是奥村燐的养父藤本为了保护燐而丧命，奥村燐也为此决意继承养父成为驱魔师，与魔神展开战斗。