第一，员工擅自离职的法律危害有哪些员工擅自离职，如果用人单位没有及时办理解除劳动合同手续，员工很可能会回来向用人单位主张工资、加班费等并且此时用人单位与员工的劳动关系，在法律上依然存续，这时若员工在外发生人生意外伤害，尤其是死亡的，其家属极有可能把责任以及赔偿问题，推到公司、用人单位身上。第二，用人单位应如何应对和处理首先，用人单位应当以书面形式送达通知书，限定员工在指定是时间内回公司上班，并提出如限期内不上班的处理措施。其次，当员工擅自离职达到可以辞退的标准时侯，用人单位应当将解除劳动关系的事宜公开，并以书面形式送达离职通知书给员工，通知其前来办理交接工作以及离职手续。送达日期，以签收日期为标准。必要时，用人单位可以在报纸上登声明。同时，制定详细的《员工入职申请表》。