法律分析。劳动合同中是否有通过绩效考核来扣绩效工资的约定，若有则就是合法的，但扣了绩效工资之后低于当地最低工资标准的话，那就是不合法的。绩效能不能扣除，首要的关键在于 劳动合同 中是否约定绩效工资。法律依据。《中华人民共和国劳动法》。第四十七条 用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。第四十 国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市规定，报备案。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。