建设工程合同纠纷可以约定仲裁，但前提是仲裁协议或者条款是有效的。根据《民诉解释》第215条规定，依照民事诉讼法第124条第2项的规定，当事人在书面合同中订有仲裁条款，或者在发生纠纷后达成书面仲裁协议，一方向人民起诉的，人民应当告知原告向仲裁机构申请仲裁，其坚持起诉的，裁定不予受理，但仲裁条款或者仲裁协议不成立、无效、失效、内容不明确无法执行的除外。第216条规定，在人民首次开庭前，被告以有书面仲裁协议为由对受理民事案件提出异议的，人民应当进行审查。由上述可知，仲裁条款具有抗辩效力，阻却对于争议事项的管辖。一、合同约定仲裁又诉讼可以吗。关于这个问题，《仲裁法》第五条规定：当事人达成仲裁协议，一方向人民提起诉讼的，人民不予受理，但仲裁协议无效的除外。