1、医疗事故纠纷是可以申请仲裁的，根据《医疗事故处理条例》第四十六条：发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；2、不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。