擅自发行企业债券罪的处罚：未经批准，擅自发行股票或企业债券，数额巨大、后果严重或有其他严重情节者，可处有期徒刑或拘役，并处非法募集资金金额1%至5%的罚金。单位犯罪者，单位罚款，负责人员可处有期徒刑或拘役不超过5年。法律分析；擅自发行企业债券罪处罚如下：根据《中华人民共和国刑法》规定，未经国家有关主管部门批准，擅自发行股票或者公司、企业债券，数额巨大，后果严重或者有其他严重情节的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处非法募集资金金额百分之一以上百分之五以下罚金。单位犯罪的，对单位处以罚款，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处五年以下有期徒刑或者拘役。拓展延伸；企业债券违法行为的法律责任及惩罚措施。